自1995年问世以来，微型微阵列分析已成为全球基因组学、蛋白质组学、药学和临床实验室的主流分析技术。最初的微阵列芯片是由斯坦福大学的帕特·布朗开发的，利用沉积在底物上的寡核苷酸探针来发现细胞的基因组组成。在最初的关注之后，这项技术迅速扩展到利用其他相关的探针(如DNA、RNA、多肽、碳水化合物)。
除了扩大分子探针的类型外，这项技术还增加了探针可以连接到的基底类型。玻璃载玻片、塑料/二氧化硅芯片和二氧化硅或聚苯乙烯珠现在可以用作构建微阵列的介质。
微阵列玻片（Arrayit公司）。
微阵列设计与实验
通常，一个微阵列由一组微米大小的点组成，这些点是一个有序批次中“打印”的给定探针。这些斑点是单一的、已知的寡核苷酸、肽或碳水化合物。它们通常通过氢键固定在表面上。一旦连接，一组蛋白质、核酸或全细胞裂解物用标签（荧光团、金属或化学发光）标记并与探针杂交。彻底清洗后，光学检查粘合程度。
这种方法测量杂交的程度，从中可以得出一些结论。研究人员利用这些数据来确定基因型、特定mRNA的丰度、蛋白质的存在和水平，甚至小分子亲和力。
微阵列有无数的应用。微阵列实验可以在短时间内产生大量数据。事实上，微阵列分析中的限速步骤现在已经变成了输入的处理。通过微阵列分析（与其他分析技术一样）产生的“大数据”非常广泛，以至于生物信息学领域也在同步发展。
最后，目前用于内部打印微阵列的设备相对便宜，几乎所有实验室都可以使用这种研究方法。应仔细考虑选择用于微阵列分析的适当材料。
选择介质:珠子、幻灯片还是芯片?
当选择用于微阵列分析的培养基时，考虑这些因素。实验室可选择从制造商处购买预印刷微阵列芯片和珠子，或在实验室内印刷基板。预印刷产品使用一组已知的探针进行制备，该探针专为细胞、组织类型或细胞过程而设计。玻璃载玻片通常用于内部打印，用户可以根据需要选择一组独特的探针进行询问。
微阵列分析（对照=红色）。
微阵列玻片通常由极低折射率的玻璃制成，在洁净室内制造以防止污染。特定于应用的表面化学物质覆盖在载玻片上。使用价格合理的仪器很容易固定探针。内部打印的明显好处是能够选择自己的探针。预先打印的微阵列通常包含不适用于研究人员正在进行的研究的探针。
由于用于内部打印的制造能力和技术类型有限，与从制造商处获得的芯片相比，这些芯片通常具有较低的杂交效率。正在处理大量微阵列的实验室将受益于实验室内打印成本的降低，而那些进行少量实验的实验室可能会发现购买预打印幻灯片更具成本效益。
预先打印的微阵列通常被标记在二氧化硅或塑料芯片上，或固定在珠子上。塑料和硅芯片传统上用于构建微阵列。这些芯片得益于近零度的反射和固有荧光，这些条件会产生背景噪声。此外，这些载玻片大量生产，并严格控制和测试数据质量和杂交性能。
微阵列打印针（Arrayit）。
以珠为基础的分析也得益于这种程度的控制。此外，它们可以在溶液中进行，避免了使用专门的杂交和洗涤设备处理易碎介质的需要。使用专门的多通道荧光仪器是珠基分析的主要缺点。此外，这种分析技术可以通过比较两个独立荧光团的比例来识别单个探针，但必须在最小波长下进行测量。尽管有这些缺点，许多实验室将选择购买效率更高的预配置芯片和珠子，不需要内部的微阵列打印机。
无论您选择购买微阵列芯片或珠子，还是打印自己的微阵列，这些实验都为您提供了在短时间内收集大量数据的机会。传统上，蛋白质组学和遗传学实验室需要一次一个地研究基因和蛋白质。微阵列的出现改变了这一动态，因此现在即使是最小的实验室也可以在单个实验中研究整个基因组或蛋白质组。
